小分子化合物的自组装研究——清析客户检测案例

类别：客户案例 135 2023-11-27

2023年9月10日，工程师接到湖南省某大学的计算需求。接到反馈后，第一时间与客户进行详细沟通，具体情况如下：

客户背景

客户是湖南省某大学的老师，希望通过模拟计算软件，分析以下问题：单晶数据中分子堆积对应带状结构，动力学过程导致扭曲得到螺旋结构，通过模拟计算希望得到螺旋对应的分子堆积。

根据客户要求所建模型具体如下：

客户想得到类似下图的结果：

客户实验制得螺旋结构晶体，具体实验细节：滴铸法（该分子为多晶形，仅在该方法下可得到螺旋结构，若在大量溶液中组装则对应另一种晶形）、4mM及以上浓度（取决于不同溶剂对分子的溶解性）模拟选择溶剂可选以乙腈或异丙醇。

客户猜想这种动力学过程导致扭曲得到螺旋结构，想通过模拟计算希望得到螺旋对应的分子堆积。

此计算难度非常大，我们下单前和客户沟通，表明这个我们努力尝试去完成。

调研研究发现，足够数量的小分子在一定条件下经过动力学模拟后能自组装形成螺旋状的纤维状纳米团簇结构。本项目采用分子动力学（Molecular dynamics, MD）模拟方法对小分子的自组装过程展开了研究。

我们进行了大量尝试，刚开始都不能达到客户预期。

由于花费时间很多，我们和客户说明，这个难度很大，如果客户愿意继续，我们继续，如果不想继续尝试，我们愿意不收费退单。客户觉得我们很专业，也很努力，愿意继续让我们尝试。

最终，经过近两个月的尝试，我们达到了客户的预期，客户对结果也很满意。