差异蛋白质的筛选和生信分析——清析客户检测案例

类别：客户案例 56 2024-03-12

2024年1月16日，客服中心反馈有来自沈阳某大学的测试委托，涉及到差异蛋白质的筛选和生信分析，需要进行lable free蛋白质组学。蛋白质实验室工程师第一时间与客户进行详细沟通，情况如下：

客户背景

客户来着沈阳某大学，共有两组样品（6个样），想分析差异蛋白表达并进行生信分析。

样品名称

蛋白质磁珠

客户需求

客户表示共有两组样品（6个样），想分析差异蛋白表达并进行生信分析，工程师确认lable free蛋白质组学符合测试需求，

解决方案

工程师第一时间对样品测试条件进行分析。客户表示样品是蛋白质溶液，并提出能否交付磁珠由实验室进行蛋白筛选和富集。工程师表示可以，进一步与客户确认磁珠处理条件为磁珠加入pbs后100℃加热10分钟，然后取上清进行后续实验。随后客户表示样品非模式生物，需要搜指定物种库，工程师确认物种为Trypanosoma brucei brucei TREU927。实验室接到干冰寄送的磁珠样品，筛选后，对蛋白质进行酶切，除盐后进行RPLC-MS进行质谱检测，并采用PEAKS软件进行数据库检索。

客户反馈

客户查看结果后，对数据较为满意，提出进行进一步筛选的要求，希望筛选出在t1，t2，t3都表达，在c1，c2，c3都不表达的蛋白，找出T组特异性的独有蛋白质。实验室重新设置筛选条件，按照要求筛选出71个符合要求的蛋白，交付给客户。客户满意数据结果。

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