山东小分子荧光探针与2CEV蛋白间的相互作用——清析客户检测案例

类别:客户案例 484 2022-12-16
2022年11月25日,本人接到来自山东某大学的客户咨询,于第一时间与客户取得联系并了解客户的计算需求,具体沟通情况如下;

客户背景


客户是来自山东某大学的同学,研究课题为:分析其发现的特定小分子荧光探针是如何与2CEV蛋白结合的,确实两者结合的氨基酸种类,两者结合的作用力体现。

模型名称


PDB数据库中的晶体结构(PDB ID:2CEV)蛋白模型、根据客户提供的荧光探针建立相关的荧光探针模型


客户需求


通过分子对接以及分子动力学方法研究小分子荧光探针与2CEV蛋白间的相互作用,期望模拟结果可以体现小分子荧光探针与2CEV蛋白间件的结合方式。与蛋白里的哪个氨基酸产生的作用、以及是何种作用力。


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