分子动力学模拟_检测机构

类别：实验测试 142 2024-01-11

清析技术研究院可提供分子动力学模拟测试相关的测试检测服务，可出具备CMA/CNAS资质的检测报告，是专业的第三方检测机构。详情可联系我们进行咨询，关于分子动力学模拟测试的部分内容介绍如下：

分子动力学模拟测试周期是多久？

到样后7-10个工作日可出具检测报告（可加急），根据样品及其检测项目/方法会有所变动，具体需咨询工程师。

分子动力学模拟是基于牛顿力学原理模拟原子和分子的物理运动轨迹和状态的方法。对于较为复杂的生物分子体系，通常通过对相互作用粒子的牛顿运动方程进行数值解析来确定体系内粒子的轨迹，而粒子间的作用力和势能采用分子力学力场来确定。

1、确定起始构型

一个能量较低、结构合理的起始三维构型是进行MD模拟的第一步。生物大分子的起始构型主要来自实验数据，如X射线晶体衍射法或核磁共振波谱法测定的分子结构，或根据已知分子结构通过同源建模得到的结构等。

2、选用适当力场和模拟软件

选择适当的力场是进行MD模拟的基础。不同的力场具有不同的适用范围和局限性，需要根据所研究的体系和问题适当选取。同时使用多种力场时，应当注意所用力场间的兼用性。

3、构建体系和能量最小化

已经有了研究对象分子的起始构型，接着要根据研究对象所处的环境（如气相、水溶液或跨膜环境等）构建模拟体系，在生物大分子周围加上足够的溶剂分子。体系的大小和模拟元胞的形状依具体体系而定，需要兼顾合理性和可行性。

4、平衡过程

体系构建好之后要赋予各个原子初始速度，这一速度是根据一定温度下的玻尔兹曼分布随机生成的，然后对各个原子的运动速度进行调整，使得体系总体在各个方向上的动能之和为零，即保证体系没有平动位移。

5、数据采集过程

体系达到平衡之后则可以进行长时间的模拟，从这个过程中采集样本进行分析。采样要在系统平衡后进行，可记三条轨迹，即体系中粒子的坐标、速度和能量随时间的变化。

6、MD结果分析

结果分析主要是通过系综平均得到可与实验结果相比较的宏观物理量。数据分析可用的工具有多种，常用MD软件包内包含一些结果分析程序，也可以根据需要自编一些结果分析软件。

1、联系/咨询工程师，详细沟通了解检测需求；

2、工程师根据检测项目及检测需求进行报价；

3、双方确定签订合同及保密协议；

4、寄样/取样，开始检测；

5、完成检测，出具检测报告，进行后期服务；

1、为公司企业、高等院校、科研单位、事业单位、医院、律师事务所以及个人客户等提供专业技术服务。

2、具备专业的CMA/CNAS资质认证，检测资质齐全，为客户提供专业的咨询与服务。

3、实验室仪器设备种类齐全，保证测试数据准确可靠；

4、拥有强大的检测专家团队，全国各地多家分支机构；

5、在线一对一服务流程，根据客户需求制定特色检测方案和解决办法；

如有相关检测需求欢迎通过在线咨询，微信咨询，拨打热线，预约检测留言等方式进行咨询，实验室工程师将会一对一为您详细解答。