南京分子对接模拟计算——清析客户检测案例

类别：客户案例 507 2023-02-08

2022年11月1日，本人接到南京某大学的老师的计算需求。接到反馈后，第一时间与客户进行详细沟通，具体情况如下：

客户背景

客户是南京某大学的老师，希望通过模拟计算软件，计算得出ZIF-8和LeuDH及亮氨酸脱氢酶（LeuDH）和葡萄糖脱氢酶脱氢酶（GDH）的双酶连接复合酶（LeuDH-sc-st-GDH）的潜在结合位点。

ZIF-8框架结构、双酶复合体的结构（模型如下图所示）

客户希望通过分子对接模拟，得出：ZIF-8和LeuDH及双酶复合体的结合位点，是在ZIF-8框架表面还是ZIF-8晶体中心。

构建ZIF-8和蛋白结构模型，采用专业的大分子与蛋白对接的HDCOK程序进行对接，选取对接打分最好的结构作为标准结果进行后续的相互作用分析。

数据结果符合预期，与客户确认结构模型时建模精确，计算周期也客户承诺一致。最后计算结果符合客户预期，客户对于计算结果非常满意，对工程师的专业度也很认可。